Для того чтобы ускорить работы yum нужно перед первым запуском.
yum install yum-fastestmirror Данный пакет, выберет самые быстрые репозитарии.
yum clean all подчистим кэш yum.
Запуск обновлений прост
yum upgrade или yum update
Полезно смотреть логи, можно этот процесс автоматизировать. Но я не советую.
А так для того чтобы добавить cron, выполните следующие crontab -e и впишите в соответствие как вам нужно.